近日，我院段莉莉教授课题组在国际著名期刊《The Journal of Physical Chemistry Letters》上先后发表了题为“Immune Escape Mechanisms of SARS-CoV-2 Delta and Omicron Variants against Two Monoclonal Antibodies That Received Emergency Use Authorization”和“Molecular Mechanism of the Non-Covalent Orally Targeted SARS-CoV-2 Mpro Inhibitor S-217622 and Computational Assessment of Its Effectiveness against Mainstream Variants”的学术论文。山东师范大学为第一署名单位，第一作者为硕士生熊丹阳，通讯作者为华东师范大学的张增辉教授和段莉莉教授。
图1.文章标题及摘要截图
工作一：
作者利用分子动力学模拟结合精确自由能计算方法研究了当前最为流行的SARS-CoV-2 Omicron变体对两种获得美国食品药品监督管理局紧急使用授权的单克隆抗体的免疫逃逸机制。
图2.单克隆抗体作用示意图及突变位点展示。
工作二：
作者对SARS-CoV-2 Mpro的非肽类非共价口服抑制剂S-217622进行了详细的作用机理分析，且评估了六种常见变体对S-217622的作用模式影响。无论是整体的还是各残基的微小的能量差异结果显示，各体系的结合模式几乎没有变化，S-217622对这些主流变体依然具有抑制作用。
图3.结合自由能及相互作用结果展示
以上研究获得国家自然科学基金面上项目资助
文章链接：https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.2c00912 https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.2c02428
